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针刀医学最早诞生于1976年。1978年，这一全新的疗法被江苏省卫生厅列入重点科研课题，1980年江苏省卫生厅组织江苏省人民医院、江苏省中医院、南京中医学院第二附属医院和南京铁道医学院附院等几家大医院对小针刀疗法进行了严格的临床实证检验，1984年通过了专家鉴定，从而标志着“针刀疗法”的正式诞生，1986年经省政府批准开始向全国推广。
2003年由国家中医药管理局组织了27所高等中西医院校的29名专家及院士参加的鉴定会，会上专家们一致认为鉴于“针刀疗法”已经不能完全反映针刀技术的现状（理论和诊疗技术），建议今后称为 “针刀医学”，从此“针刀医学”诞生。同年，高等教育创新教材《针刀医学》（上、下册）由国家中医药出版社出版，成为中、西医高等院校的选修课教材。
2004年由教育部组织的有4位院士参加的关于针刀医学原创性和推广应用的鉴定会上，专家一致认为“针刀医学在理论、技术、器械等方面具有原创性，特别是在临床治疗方面达到了国际领先水平”。
2005年全国高等中医院校规划教材《针刀医学系列》（5本）获准由中国中医药出版社出版，成为高等中医药院校本科生教材。“针刀治疗膝骨性关节炎的实验研究”获得教育部二等奖。同年，“针刀松解法的基础研究”获国家973计划中医理论专项资助。
2006年2月在中国科协发起的“北京香山科学会议”上，到会的院士和专家一致认为针刀医学是中医学范畴当中具有原创性的新学科，是中医现代化的范例之一。
以上是针刀医学发展过程中的几个重要的历史阶段。
另外据中国科学院数学与系统科学研究院应用数学研究所抽样调查的数据处理报告显示：一、经济效益：在针刀治疗所需费用中，药物所需费用仅占全部费用的15.7%；在针刀闭合性手术适应症范围内，目前全国每年针刀门诊比外科手术节约治疗费用6.8亿；在针刀闭合性手术适应症范围内，目前全国每年针刀疗法闭合性手术比外科手术节约治疗经费总共605.64亿元，比药物和其它治疗方法节约总共172.24亿元。二、社会效益：目前全国每天接受针刀治疗的就诊人数达360723人次；目前全国每天接受针刀治疗的住院患者人数达14064人；目前全国针刀专科医院达369所，针刀门诊部达2166家，设立针刀科的医院达3432家。
三十一年来，针刀医学队伍迅速发展，在国内外成立了众多针刀医学会，产生了较大影响。1990年全国成立了中华中医药学会针刀医学分会；国内有28个省（市、直辖市、自治区）相继成立了省级针刀医学会，针刀医疗机构5500多个；国外有15个国家和地区也相继成立了针刀医学会，针刀医疗机构1251个；2004年成立了世界性的“世界中医药联合会”针刀专业委员会。
针刀医学是在针刀疗法的基础上发展而成的一门新学科。自1976年至今，针刀医学已经走过31个春秋。当初朱汉章教授首创针刀疗法，把针灸针与外科手术刀的两种长处融为一体，使骨伤科的切割、剥离、松解等手术由开放变成闭合，明显提高了对慢性软组织损伤、骨质增生等类疾病的治疗效果。后来发展为针刀医学，不但使针刀疗法的适应症从骨伤科疾病扩展到内、外、妇、儿、五官、皮肤等科的疾病，而且还对许多常见病、疑难病的发病原因、发病机理和针刀治疗机理提出来一系列符合临床实际的理论和见解，其中关于慢性软组织损伤的病因病理学理论，关于骨质增生的病因学理论，关于脊柱区带病因学理论，以及针刀调节机体功能使之恢复平衡的理论，不论对中医或西医来说，都是在前人的基础上的新进展，具有重大的应用价值和理论价值。
“实践是检验真理的唯一标准” 这句名言最能证明针刀医学的优越性，科学性。
正是因为针刀医学可重复的科学性和临床的先进性，让它在这短短的三十一年来
被越来越多的老一辈医学专家、医学同仁、有识之士所肯定和推广， 发展速度尚属我国历史罕见。
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